常見的實驗室凈化工程裝修材料有夾心彩鋼板、鋼化玻璃、防火板等，潔凈實驗室必須按照《潔凈室施工與驗收標準》采用可以較好的密封并且不產塵的材料進行隔斷、吊頂裝修，潔凈實驗室通風系統一般采用組合式空調機組，其送風系統與各業潔凈室工程不同的地方是，不是所有實驗室都可以設置回風系統的，這需要根據用戶實驗室的用途以及實驗產品而定。類似于生物類實驗室就不可以做回風系統，或者說要以全排式潔凈室的做法來施工。

潔凈室是指將一定空間范圍內之空氣中的微粒子、有害空氣、等之污染物排除,并將室內之溫度、潔凈度、室內壓力、氣流速度與氣流分布、噪音振動及照明、靜電控制在某一需求范圍內,而所給予特別設計之房間。亦即是不論外在之空氣條件如何變化,其室內均能俱有維持原先所設定要求之潔凈度、溫濕度及壓力等性能之特性。

萬級無菌室容積小而嚴密，使用一段時間后，室內溫度很高，故應設置通氣窗。通氣窗應設在內室進門處的頂棚上(即離工作臺zui遠的位置)，為雙層結構，外層為百葉窗，內層可用抽板式窗扇。通氣窗可在內室使用后、自凈前開啟，以流通空氣。有條件可安裝恒溫恒濕機。

在實驗室內配備生物柜。設洗眼設施，必要時應有應急噴淋裝置。考慮機械通風，如使用窗戶自然通風，有防蟲紗窗。有可靠的電力供應和應急照明。必要時，重要設備如培養箱、生物柜、冰箱等應設備用電源。實驗室出口有在黑暗是可明確辨認的標識。