花鰱魚屬于典型的濾食性魚類，靠腮的特殊結構濾取水中的浮游生物，終生以浮游生物為食，在魚苗階段主要吃浮游動物，長達1.5厘米以上時逐漸轉為吃浮游植物，并喜吃草魚的糞便和投放的雞、牛糞，亦吃豆漿、豆渣粉、麩皮和米糠等，更喜吃人工微顆粒配合飼料。花鰱魚對酸味食物很感興趣，對糟食也很有胃口。鰱魚喜食腐爛食物，常與草魚搭配飼養鰱魚吃草魚的糞便，故有一草養三鰱之說。